Komunalni otpad iz Hercegovine onečišćuje korito i obale rijeke Neretve, a indirektno ugrožava i zdravlje ljudi jer se otpad mjesecima zadržava uz obalu, ali najveće količine ipak odu u more. Plastika (vrećice, boce i čepovi) koji doplutaj iz gornjeg toka rijeke Neretve na kraju jedu i ribe (mikroplastiku) misleći da je plankton, zbog čega ta plastika završava u ljudskom organizmu. Uz to, onečišćuju se i podzemne vode. Problem su divlji deponiji, kao u Čapljini koji su nedaleko od korita rijeke Neretve te plastika iz Mostara, što sve na kraju završi u Neretvi od Metkovića do Ploča, a kasnije dopluta i u more do obala Pelješca, Brača i Hvara, objavila je Slobodna Dalmacija.