Na temelju članka 104, stavka 1, točke 8. Zakona o otpadu (NN 178/2004 i 111/2006), Ministarstvo zaštite okoliša, prostornog uređenja i graditeljstva, uz suglasnost Ministarstva zdravstva i socijalne skrbi donijelo je Pravilnik o gospodarenju medicinskim otpadom (NN 72/2007). Njime se uređuju načini i postupci gospodarenja medicinskim otpadom koji nastaje prilikom pružanja zaštite zdravlja ljudi i životinja i iz srodnih istraživačkih djelatnosti. Gospodarenje medicinskim otpadom u smislu Pravilnika podrazumijeva njegovo odvojeno skupljanje i privremeno skladištenje na mjestu nastanka, a u okviru djelatnosti gospodarenja njime: skupljanje i prijevoz te privremeno skladištenje, obradu, oporabu i/ili zbrinjavanje te oporabu i/ili zbrinjavanje otpada koji nastaje obradom, oporabom i/ili zbrinjavanjem medicinskog otpada. Odredbe Pravilnika ne odnose se na gospodarenje radioaktivnim medicinskim otpadom te ostalim vrstama otpada koje nastaju u zdravstvenoj djelatnosti koje se uređuje posebnim propisima niti na postupke sterilizacije uzgojenih mikroorganizama te tkiva i opreme koji spadaju u djelatnost redovitog radnog procesa mikrobioloških i sličnih laboratorija kao i kirurških i sličnih odjela i ordinacija koji se ne smatraju djelatnošću gospodarenja otpadom i obavljaju se sukladno pravilima medicinske struke. Pravilnik stupa na snagu osmoga dana od dana objave u 'Narodnim novinama'.