Vrijednost neto imovine fonda na dan 31. prosinca 2011. iznosi 966,8 milijuna kuna ili 128,4 milijuna eura, što je za 14,1 milijun eura veća od uplaćenog i predstavlja neto prinos Fonda. Fond je dužan za financiranje svih aktivnosti vezanih za izradu, reviziju i provedbu Programa razgradnje NE Krško i odlaganja RAO i istrošenog nuklearnog goriva. Na projektu Druge revizije Programa razgradnje od 2010. radi APO, koji je za taj posao plaćen 343 tisuće eura uvećano za PDV. Recenzija nacrta 2. revizije Programa razgradnje koju treba napraviti Međunarodna agencija za atomsku energiju "iz objektivnih razloga" nije izvršena u 2011., stoji u izviješću. Fond je proveo javnu nabavu za izradu studije "Analiza hrvatskih opcija zbrinjavanja radioaktivnog otpada", planirane vrijednosti 640.000 eura, no tu je nabavu poništila Državna komisija za kontrolu postupaka javne nabave, pa će taj novac biti iskorišten ove godine.
Kako bi se uvećao novac u Fondu ta institucija ulaže sredstva i to 77% u obveznice, dok je udio depozita smanjen na 9,7%, kao i udjeli u investicijskim fondovima na 8,7%, a prinos od ulaganja u 2011. iznosio je 4,3 milijuna eura. Zanimljivo je da je Fond ostao bez dijela sredstava koje su imali oročeni u Credo banci koja je u stečaju.
