Konvencionalna biogoriva poput biodizela povećavaju emisije CO₂ i mogu se smatrati preskupom dugoročnom alternativom, stoji u nacrtu studije Europske unije "Promet u EU i emisije stakleničkih plinova: Putevi do 2050. Ta studija je konstatirala da je potencijal smanjenja CO2 biogorivima po trenutnim cijenama emisijskih kvota potpuno neisplativo, odnosno čak je 49 puta skuplje nego što bi bilo kupovati emisijske kvote na tržištu po cijeni od 6,14 eura po toni. Autori studije ipak konstatiraju da nije moguće, a niti korisno odrediti isplativost za konvencionalna biogoriva zbog njihovog indirektnog efekta koji se mjeri u iskrčenim šumama i pašnjacima, čime proizvodnja biodizela zapravo proizvodi CO₂. David Laborde, jedan od vodećih agronoma i autor ključnih izviješća o biogorivima za Europsku komisiju konstatirao je da je Europskoj uniji lakše davati poticaje seljacima i industriji biogoriva pod krinkom energetske sigurnosti, nego dobavljati mineralna goriva s Bliskog istoka, "iako se pokazuje da to nije 'zeleno', niti efikasno", prenosi Euractiv.