U razdoblju od 27. do 29. rujna 2011. godine certifikacijska kuća Bureau Veritas obavila je drugi recertifikacijski audit integriranog sustava upravljanja Janaf kojim su obuhvaćene sve lokacije i organizacijske cjeline Janafa. Nakon temeljitog pregleda integriranog sustava upravljanja zaključeno je da se valjanost certifikata produži za naredne tri godine, do prosinca 2014., te su sredinom listopada 2011. godine Janaf i službeno uručeni certifikati ISO 9001:2008 (Sustav upravljanja kvalitetom), ISO 14001:2004 (Sustav upravljanja zaštitom okoliša) i OHSAS 18001:2007 (Sustav upravljanja zaštitom zdravlja i sigurnosti). Uspješnim recertificiranjem integriranog sustava upravljanja prema izdanju međunarodnih normi, Janaf je jedna od rijetkih tvrtki u Hrvatskoj, a naročito onih u pretežito državnom vlasništvu, koja je certificirana prema zahtjevima triju međunarodne norme. Poslovanjem u skladu sa zahtjevima navedenih međunarodnih normi Janaf dokazuje težnju za trajnim poboljšanjem kvalitete poslovanja, brigu o korisnicima svojih usluga te o zaštiti okoliša, zdravlja i sigurnosti. Uspostavom i održavanjem ISO standarda, Janaf ne samo da prihvaća zakonom propisane norme, nego sam određuje više kriterije i sustavno nadzire stanje poslovnih aktivnosti. Inače, Janaf od prosinca 2005. godine svoje poslovanje vodi i organizira prema zahtjevima međunarodnih normi ISO 9001:2008, ISO 14001:2004 i OHSAS 18001:2007, priopćeno je iz te kompanije.